يعتبر القسم البيطري القسم المركزي في رياضة الفروسية بشكل عام حيث يتعامل مع كافة ما يتعلق بالخيول وهي اساس رياضة الفروسية , من حيث اصدار كافة الوثائق والجوازات والتسجيل, وتطبيق كافة القوانين والانظمة التي تتعلق بصحة وسلامة الخيول وهي الاولوية الدائمة في هذه الرياضة . ولتحقيق هذه الاهداف يقوم القسم البيطري في اتحاد الامارات للفروسية والسباق بتنظيم الدورات البيطرية لكافة الاطباء البيطريين الرسميين والمسجلين من اجل اطلاعهم على اهم المستجدات في عالم الفروسية بالإضافة الى احدث القوانين والانظمة.
كما يتم وبالتعاون مع الاقسام الاخرى في الاتحاد بعقد الدورات التثقيفية لكافة المعنيين من فرسان ومدربين وملاك خيول في مجال صحة وسلامة الخيول وتفادي استخدام الادوية الممنوعة والمنشطات .
كما يشارك في العديد من اللجان الوطنية التي تعنى بسلامة الخيول بوضع سياسات الاستيراد والتصدير ومكافحة اية امراض معدية
ويقوم القسم البيطري بتنسيق وتنظيم فحوصات المواد والادوية الممنوعة خلال مسابقات الفروسية
وتعتبر المعايير والانظمة البيطرية في دولة الامارات العربية المتحدة التي تضمن سلامة الخيول وصحتها من افضل الانظمة على مستوى العالم وما يدل على ذلك البطولات العالمية التي ينظمها الاتحاد الدولي للفروسية في دولة الامارات .